Микробиологические исследования :: Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника

Срок выполнения: 4 дня .

Синонимы и связанные понятия

Antagonistic activity of probiotics and bacteriophage sensitivity test, Intestinal dysbacteriosis, Intestinal dysbiosis, анализ кала на дисбактериоз, дисбиоз кишечника, определение пробиотиков-антагонистов

Приём биоматериала

• Анализ нужно сдать в первой половине дня.
  Проверьте сокращенный график на странице нужного отделения
• Можно сдать в отделении Тула-Мед
• Правила подготовки к анализу

Зачем сдавать этот анализ?

Показания для проведения исследования:

• диарея;
• длительное восстановление после кишечных инфекций;
• длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удаётся выделить патогенные микроорганизмы;
• дисфункция кишечника у пациентов, которые подвергались длительному воздействию радиации или химических веществ (бисфенолов, фталатов, стойких органических загрязнителей, тяжёлых металлов и пестицидов);
• интенсивная антибиотикотерапия и/или иммунодепрессивная терапия, гормональная терапия, химиотерапия;
• гнойно-воспалительные очаги, трудно поддающиеся лечению: пиелонефрит — инфекционное воспалительное заболевание почек, холецистит — воспаление жёлчного пузыря, язвенный колит — хроническое воспалительное заболевание толстой кишки, энтероколит — воспаление слизистой оболочки тонкого и толстого кишечника, вялотекущая пневмония — один из видов воспаления лёгких, который относят к очаговым заболеваниям, протекающим в лёгкой форме.

Подробное описание исследования

Микробиоценоз кишечника. Дисбактериоз

Микробиоценоз кишечника — совокупность микроорганизмов, населяющих кишечник. Их принято разделять на три группы: полезные, условно-патогенные (условно вредные) и патогенные (вредные).

И полезные, и условно вредные микроорганизмы живут на слизистой оболочке кишечника и выполняют ряд защитных функций, а взамен питаются веществами, которые поступают в кишечник.

Полезные микроорганизмы стимулируют иммунную систему, улучшают пищеварение и всасывание питательных веществ, подавляют размножение болезнетворных бактерий.

Полезные бактерии:

• бифидобактерии,
• лактобактерии,
• энтерококки,
• типичные формы кишечной палочки,
• бактероиды.

Условно вредные микроорганизмы присутствуют в кишечнике и не причиняют вреда, пока их количество не превышает допустимых значений. Если же концентрация условно вредных бактерий растёт, то баланс в кишечнике нарушается и могут появиться симптомы дисбактериоза: диарея, запор, изжога, тошнота и т. д.

Условно вредные бактерии:

• неферментирующие бактерии,
• грибки,
• энтеробактерии,
• клостридии,
• стафилококки.

Также в кишечнике могут встречаться вредные бактерии, которые в норме не обнаруживаются. В их число входят энтеробактерии, вызывающие острые кишечные заболевания:

• патогенные эшерихии,
• сальмонеллы,
• шигеллы.

Состояние, когда естественный баланс микрофлоры слизистой оболочки нарушается, называют дисбактериозом (дисбиозом) кишечника.

Основные причины дисбактериоза: увеличение концентрации условно-патогенных бактерий, развитие патогенной микрофлоры.

Чтобы определить причины дисбиоза кишечника и назначить лечение, проводят микробиологическое исследование микробиоценоза кишечника.

Микробиологическое исследование кишечника

Микробиологическое исследование — один из наиболее точных методов, которые применяются при диагностике дисбактериоза. Этот метод позволяет исследовать совокупность всех микроорганизмов, обитающих в кишечнике.

Для проведения анализа биоматериал засевают на специальные питательные среды, необходимые для роста и накопления микроорганизмов, и через три — пять дней оценивают результаты.

Посев на дисбактериоз кишечника позволяет сосчитать выросшие колонии (КОЕ, или колониеобразующие единицы), идентифицировать (распознать) микроорганизмы, определить их количество и соотношение различных видов.

Идентифицируют микроорганизмы по следующим признакам:

• морфологическим — изучают строение под микроскопом;
• культуральным — оценивают потребности, условия и тип роста на питательных средах;
• биохимическим — определяют набор ферментов, синтезируемых в процессе жизнедеятельности.

Также исследуют чувствительность микроорганизмов к бактериофагам (вирусам, которые проникают в бактерии и уничтожают их) и антибиотикам, чтобы разработать индивидуальный план терапии.

Источники

1. Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника : методические рекомендации / Минздрав РСФСР. 1977.
2. Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника : ОСТ 91500.11.0004-2003.
3. Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркерам содержимого кишечника : федеральные клинические рекомендации. 2005.
4. Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «Ассоциация колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile — ассоциированной диареи (CDI). 2017.
5. Chan B. K., Abedon S. T., Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy // Future Microbiol, 2013. Vol. 8(6). P. 769–783. doi:10.2217/fmb.13.47
6. Robles A. V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health // Br. J. Nutr., 2013. Vol. 109. Suppl 2:S21—26. doi:10.1017/S0007114512005235

Подготовка к исследованию

• За 14 дней до анализа необходимо прекратить приём антибиотиков.
• За 72 часа до исследования отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приёма препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.
• В течение 3 дней до взятия пробы нужно соблюдать диету: отказаться от алкоголя, молока, гороха, сои, углеводов (сахара, яблок, винограда, белого хлеба и т. п.), кисломолочных продуктов (сметаны, кефира, йогурта и т. д.) и других продуктов, усиливающих процессы брожения.
• Кал нужно собрать без использования клизм или слабительных средств — при условии самостоятельного опорожнения кишечника.
• Биоматериал не должен содержать примеси мочи, воды, выделений половых органов.
• Кал собирают с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, допускается использовать судно или горшок. Нельзя собирать кал из унитаза, с пелёнки, подгузников с гелевым наполнителем, а также использовать дезинфицирующие средства. Поверхность для сбора материала нужно хорошо вымыть с мылом, 3–4 раза ополоснуть проточной водой, обдать кипятком и остудить. После этого тщательно высушить. Кал необходимо поместить в специальный контейнер, который нужно заранее купить в аптеке или магазине. Достаточно собрать 1–2 чайные ложки биоматериала, поместить в контейнер, после этого плотно закрыть крышку. Хранить в холодильнике при температуре +2...+8°С. Доставить в отделение в течение 3 часов после сбора. Для сохранения температуры хранения можно поместить контейнер в термос с кубиком льда или в пакет с хладоэлементами.
• Если есть необходимость отслеживать показатели в динамике, желательно сдавать каждый анализ при одинаковых условиях: в том же лабораторном отделении, тем же методом.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.

Факторы, влияющие на результат исследования:

• приём пробиотиков,
• приём антибиотиков,
• приём препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала,
• употребление в пищу продуктов, влияющих на работу кишечника и цвет кала.

Интерпретация результата

Дисбактериоз возможен в двух случаях:

1. Уровень полезных бактерий нормальный при повышенном уровне условно вредных микроорганизмов (до 107–108 КОЕ/г) либо обнаружении вредных бактерий.
2. Уровень полезных бактерий понижен (до 107–108 КОЕ/г) при нормальном уровне условно вредных бактерий и отсутствии вредных бактерий.

Важно учитывать, что микробиоценоз кишечника может изменяться в зависимости от многих параметров состояния организма, в том числе и от состава пищи.

Решение о диагнозе и назначении лечения врач принимает, опираясь на данные микробиологического исследования кала и клинического обследования пациента. Также могут понадобиться дополнительные обследования.

Референсные значения

Вид микроорганизмов	Результат, КОЕ/г
	< 1 года	1–60 лет	> 60
Бифидобактерии (Bifidobacterium)	10*10–10*11	10*9–10*10	10*8–10*9
Лактобактерии (Lactobacillus)	10*6–10*7	10*7–10*8	10*6–10*7
Энтерококки (Enterococcus)	10*5–10*7	10*5–10*8	10*6–10*7
Клостридии (Clostridium)	≤ 10*3	≤ 10*5	≤ 10*6
Кишечные палочки (E.coli) типичные	10*7–10*8	10*7–10*8	10*7–10*8
E.coli лактозонегативные	< 10*5	< 10*5	< 10*5
E.coli гемолитические	0	0	0
Другие условно-патогенные энтеробактерии: клебсиелла (Klebsiella), протей (Proteus), морганелла (Morganella), цитробактер (Citrobacter), серрация (Serratia)	< 10*4	< 10*4	< 10*4
Золотистый стафилококк (Staphylococcus aureus)	0	0	0
Стафилококки сапрофитный (Staphylococcus saprophyticus) и эпидермальный (Staphylococcus epidermidis)	≤ 10*4	≤ 10*4	≤10*4
Дрожжеподобные грибы рода кандида (Candida)	≤ 10*3	≤ 10*4	≤10*4
Патогенные микроорганизмы: сальмонелла (Salmonella), шигелла (Shigella)	0	0	0
Неферментирующие бактерии: ацинетобактер (Acinetobacter), псевдомонада (Pseudomonas)	≤ 10*3	≤ 10*4	≤10 *4